В папку с полученным исполняемым файлом поместить библиотеку libgcdfes.so, полученную в предыдущем пункте, а также необходимые файлы задачи - *.tsk, *.tsl, *.bc, *.dot, *.neu, ...
Для запуска программы нужно в LD_LIBRARY_PATH прописать пути к библиотекам mkl (если используются решатели mkl) и/или paralution (если используются решатели paralution).
В качестве альтернативы можно использовать sh-скрипт запуска. Пример sh-скрипта есть в папке gcdfes.
~~~
ВОЗМОЖНЫЕ ПРОБЛЕМЫ И ПУТИ ИХ РЕШЕНИЯ:
При использовании старых версий компилятора может потребоваться включить поддержку стандарта C++11 (в новых версиях включено по умолчанию). Делается это с помощью опции "-std=c++11".